Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSO75390 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSO75390 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSO75390 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSO75390 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms