Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms