Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM44O43615 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM44O43615 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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