Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COCHO43405 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COCHO43405 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COCHO43405 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COCHO43405 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COCHO43405 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COCHO43405 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms