Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MSI1O43347 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSI1O43347 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSI1O43347 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSI1O43347 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSI1O43347 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSI1O43347 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI1O43347 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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