Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms