Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM6BO15054 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6BO15054 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms