Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms