Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F3O00716 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F3O00716 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F3O00716 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F3O00716 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms