Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXLO00592 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXLO00592 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXLO00592 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms