Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
O00370 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
O00370 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
O00370 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
O00370 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
O00370 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
O00370 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
O00370 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
O00370 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
O00370 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
O00370 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
O00370 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
O00370 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms