Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H7C1W4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H7C1W4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H7C1W4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H7C1W4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H7C1W4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H7C1W4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C1W4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
H7C1W4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
H7C1W4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C1W4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C1W4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C1W4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C1W4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C1W4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C1W4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C1W4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C1W4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C1W4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H7C1W4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H7C1W4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H7C1W4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H7C1W4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H7C1W4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H7C1W4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H7C1W4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C1W4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C1W4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C1W4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C1W4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms