Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQ06 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQ06 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQ06 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQ06 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQ06 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQ06 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
H3BQ06 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQ06 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BQ06 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BQ06 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BQ06 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BQ06 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BQ06 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BQ06 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BQ06 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BQ06 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BQ06 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BQ06 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms