Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB9F8W1W9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms