Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPIPA5E9PKD4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPIPA5E9PKD4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms