Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NACAE9PAV3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NACAE9PAV3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NACAE9PAV3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NACAE9PAV3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NACAE9PAV3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NACAE9PAV3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms