Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms