Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms