Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SERINC4A6NH21 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms