Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms