Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTAGE9A4FU28 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms