Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms