Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms