Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0B4J203 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0B4J203 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms