Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQE9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
U3KQE9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
U3KQE9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
U3KQE9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
U3KQE9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
U3KQE9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
U3KQE9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms