Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A3GALT2U3KPV4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms