Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms