Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms