Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms