Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP15Q9Y4E8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms