Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms