Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAPPC8Q9Y2L5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms