Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
EFR3BQ9Y2G0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms