Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF8Q9UPN6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAF8Q9UPN6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms