Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TPCN1Q9ULQ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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