Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CROTQ9UKG9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CROTQ9UKG9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CROTQ9UKG9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CROTQ9UKG9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CROTQ9UKG9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CROTQ9UKG9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms