Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACL1Q9UJ83 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACL1Q9UJ83 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACL1Q9UJ83 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACL1Q9UJ83 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACL1Q9UJ83 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms