Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms