Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MED13Q9UHV7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED13Q9UHV7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms