Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms