Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms