Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms