Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
COPS7AQ9UBW8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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