Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms