Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms