Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms