Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
BARHL2Q9NY43 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BARHL2Q9NY43 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BARHL2Q9NY43 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BARHL2Q9NY43 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BARHL2Q9NY43 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BARHL2Q9NY43 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BARHL2Q9NY43 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BARHL2Q9NY43 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BARHL2Q9NY43 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms