Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBRD1Q9NUN5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms