Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCND1Q9NSA2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms