Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms